腸道微生態對於身體健康的影響重大，一些微生物的異常增長和代謝產物會加重行為障礙、疲勞、運動障礙、免疫功能障礙，這些微生物包括：細菌增長和酵母菌增生。
研究表明，蘆薈具有抗微生物、抗病毒和抗真菌的特性。另外，蘆薈中的化合物也是有效的抗氧化劑、消炎藥、抗糖尿病藥和癌症抑制劑。
多項實驗證明：
· 40%濃度的蘆薈汁已能有效遏制鏈球菌（如急性扁桃體炎、肺炎等）；
· 50%濃度或以上的蘆薈汁已能有效遏制白色念珠菌（如白色斑塊或陰道分泌物、癢）；
· 70%濃度的蘆薈汁已能遏制大部分微生物；
· 80%濃度或以上的蘆薈汁已能有效對抗病毒，包括單純性疱疹及帶狀疱疹（如唇瘡）；
· 85%濃度或以上的蘆薈汁已能有效遏制真菌，包括皮癬菌、甲真菌等（如灰指甲、牛皮癬）；
· 80-100%濃度的蘆薈汁能有效殺滅陰道毛滴蟲（寄生於女性陰道之頑強寄生蟲）。
